Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM8A1Q9UBU6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms