Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPASTQ9UBP0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPASTQ9UBP0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms