Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms