Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3BQ9UBC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms