Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUCLA2Q9P2R7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLA2Q9P2R7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms