Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH10Q9P2E7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms