Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTGFRNQ9P2B2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRNQ9P2B2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.3 ms