Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP36Q9P275 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP36Q9P275 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms