Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZSWIM5Q9P217 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZSWIM5Q9P217 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM5Q9P217 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM5Q9P217 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM5Q9P217 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ZSWIM5Q9P217 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms