Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0Z9

PIPOX, Peroxisomal sarcosine oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOXQ9P0Z9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PIPOXQ9P0Z9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PIPOXQ9P0Z9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms