Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCHIP1Q9P0W5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCHIP1Q9P0W5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms