Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CWC15Q9P013 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CWC15Q9P013 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms