Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TFCP2L1Q9NZI6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFCP2L1Q9NZI6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFCP2L1Q9NZI6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TFCP2L1Q9NZI6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TFCP2L1Q9NZI6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2L1Q9NZI6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms