Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRN3Q9NYV6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRN3Q9NYV6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms