Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DLL3Q9NYJ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms