Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP4R2Q9NY27 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms