Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC17Q9NVM6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC17Q9NVM6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms