Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
INTS9Q9NV88 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
INTS9Q9NV88 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms