Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IMP3Q9NV31 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms