Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRMT13Q9NUP7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT13Q9NUP7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRMT13Q9NUP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRMT13Q9NUP7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 431.2 ms