Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMBRD1Q9NUN5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMBRD1Q9NUN5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms