Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8A2Q9NTI2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A2Q9NTI2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A2Q9NTI2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms