Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT82Q9NSB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT82Q9NSB4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms