Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCND1Q9NSA2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms