Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOPORSQ9NS56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms