Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARHGEF3Q9NR81 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGEF3Q9NR81 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms