Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB18Q9NP72 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB18Q9NP72 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms