Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZCCHC17Q9NP64 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZCCHC17Q9NP64 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms