Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-5Q9HDB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-5Q9HDB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVK-5Q9HDB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms