Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD248Q9HCU0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms