Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LY9Q9HBG7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LY9Q9HBG7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms