Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSER2Q9H7U1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER2Q9H7U1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms