Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCL3Q9H2J4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms