Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC8Q9H0W5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC8Q9H0W5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms