Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNF541Q9H0D2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF541Q9H0D2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF541Q9H0D2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms