Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NACA2Q9H009 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NACA2Q9H009 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NACA2Q9H009 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NACA2Q9H009 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms