Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER1Q9C0I3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCSER1Q9C0I3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER1Q9C0I3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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