Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZCCHC2Q9C0B9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZCCHC2Q9C0B9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms