Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CRNKL1Q9BZJ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRNKL1Q9BZJ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms