Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTPBP4Q9BZE4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTPBP4Q9BZE4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms