Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCO2Q9BYV7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCO2Q9BYV7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms