Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX4Q9BYU1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBX4Q9BYU1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX4Q9BYU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms