Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF17Q9BXT8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
RNF17Q9BXT8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF17Q9BXT8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms