Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms