Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF7Q9BWX1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF7Q9BWX1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms