Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM109Q9BVC6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM109Q9BVC6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms