Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP8Q9BV40 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms