Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf16Q9BUW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms