Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR3CQ9BUI4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR3CQ9BUI4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms