Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PI4K2AQ9BTU6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PI4K2AQ9BTU6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms